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  • 我所最新研究成果被《关节炎研究与治疗》接收
  • 【发布时间:2016-08-19 10:31:18】  阅览:1360次  【关 闭】
  • 近日,由我所张学军教授、北京中日友好医院崔勇教授和香港大学杨万岭教授为共同通讯作者投稿到《关节炎研究与治疗》(Arthritis Research & Therapy)杂志上题目为《X染色体上发现系统性红斑狼疮新的遗传易感位点》(Discovery of a novel genetic susceptibility locus on X chromosome for systemic lupus erythematosus)的科研论文被该杂志正式接收,该研究在X染色体上发现系统性红斑狼疮(SLE)一个新的遗传易感基因位点。 
        SLE是一种以女性发病为主的自身免疫性结缔组织疾病,鉴于该病男女发病比例差别很大(1:9),我们认为X染色体上的遗传变异在该病的发生中可能起到重要作用。前期我们通过对安徽和香港两个中国汉族人群的GWAS研究的X染色体数据进行Meta分析及验证研究,在X染色体Xp22.3区域内发现了一个新的易感基因PRPS2的变异(rs7062536)与SLE的发病密切相关,同时验证出既往欧洲人群中报道的多个显著的易感基因位点。为了进一步发掘该病X染色体上新的遗传风险变异,我们在前期GWAS研究的基础上进行了新的验证研究。 
        该研究选取了12个P<0.01且既往研究未报道的SNPs位点,利用Sequenom Massarry system基因分型平台在中国汉族人群2,442例SLE病例和2,798例健康对照(中国中部人群:1,156例病例和2,330例对照;南部:1,012例病例和335例对照;北部:274例病例和133例对照)中进行基因分型验证研究,运用PLINK1.07软件以样本地域作为协变量进行关联分析。通过对GWAS初筛数据和验证阶段中部人群数据进行Meta分析,在Xp11.21区域内发现一个新的易感基因LINC01420上的变异(rs5914778)与SLE的关联达到全基因组显著水平(P = 1E-8; OR = 1.32);在南部人群的验证结果中该位点依然有统计学意义(P = 5.31E-5; OR = 1.51),把GWAS初筛数据和验证阶段中部、南部数据进行Meta分析发现rs5914778与SLE的关联性更显著(P = 5.26E-12; OR = 1.35);然而,该位点在中国北部人群中并未显示出与SLE的相关性(P = 0.33),这可能与北部人群的样本量较小有关,进一步分析显示中国北部人群和中部以及南部人群相比具有一定的遗传异质性(Phet = 0.034, I2 = 65.3)。 
        该研究通过在中国汉族人群中进行三阶段的验证研究在Xp11.21区域内发现一个新的易感基因LINC01420上的变异(rs5914778)与SLE发病密切相关,该研究进一步说明了X染色体上的遗传变异中在中国汉族人群SLE发生中起到重要的作用。(撰稿:朱正伟)
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